Miejscowość Lisowice po raz pierwszy wymieniono w dokumencie z 1295 roku. Od samego początku wierni z Lisowic należeli do parafii w Lubecku. W samym środku wsi stał drewniany krzyż, wokół którego miejscowa ludność odprawiała nabożeństwa majowe i różańcowe. Ówczesny sołtys Jan Siekiera i jego zastępca, Jerzy Gryc, wystąpili z inicjatywą budowy małej kapliczki obok krzyża na polu rolnika o nazwisku Wypler. Budowa kaplicy miała miejsce w latach 1901?1902. Rok później ks. proboszcz Gustaw Henciński zakupił do kaplicy figurę św. Jana Nepomucena. Kapliczka służyła do odprawiania nabożeństw majowych i różańcowych, a po II wojnie światowej uczono w niej religii. W 1968 roku ks. proboszcz Nagórski po raz pierwszy sprawował w kaplicy Mszę św. dożynkową. Od Wielkanocy 1972 roku sprawowano Eucharystię już w każdą niedzielę. 11 sierpnia 1974 roku gościł w kaplicy biskup Herbert Bednorz, który nakłonił ks. proboszcza Józefa Żurka i wiernych do rozpoczęcia starań mających na celu budowę kościoła. Od chwili ustanowienia wikariusza w parafii Lubecko Msze św. odprawiano codziennie, a nauka religii odbywała się w wypożyczonej na ten cel sali w remizie strażackiej. W latach 1975?1976 kaplica została przebudowana i powiększona.
W 1984 roku powstał projekt nowego kościoła oraz zaplecza duszpastersko - katechetycznego. 31 sierpnia 1987 roku biskup katowicki Damian Zimoń mianował ks. Józefa Anczoka rektorem kaplicy i budowniczym nowego kościoła, powierzając mu zadanie utworzenia w Lisowicach samodzielnej parafii. Ks. Józef Anczok razem z wiernymi oraz z wydatną pomocą ks. proboszcza Henryka Gajdy przystąpił do budowy kościoła. Nową parafię erygowano 1 stycznia 1989 roku, a budowę kościoła rozpoczęto w połowie października 1989 roku. Po pięciu latach prac, 26 listopada 1994 roku biskup gliwicki Jan Wieczorek uroczyście poświęcił nowy kościół pw. św. Jana Nepomucena. W 1999 roku założono cmentarz parafialny przy ul. Nowej. W 2008 roku sprowadzono z Pragi relikwie patrona Św. Jana Nepomucena.
